 | המאמר הזה צריך ציטוטים נוספים עבור אימות. (ספטמבר 2014) (למד כיצד ומתי להסיר הודעת תבנית זו) |
תחום טרנס-ממברני בדרך כלל מציין קטע טרנסממברני של יחיד סליל אלפא של א חלבון טרנסממברני.[1] באופן רחב יותר, תחום טרנסממברני הוא כל פורש קרום תחום חלבון.
זיהוי סלילי טרנסממברני
סלילים טרנס-ממברניים נראים במבנים של חלבוני קרום שנקבעים על ידי עקיפה רנטגן. ניתן לחזות אותם גם על בסיס סולמות הידרופוביות. כי הפנים של דו שכבתי והחללים הפנימיים של מרבית החלבונים בעלי המבנה הידוע הם הידרופובי, ההנחה היא שהיא דרישה של חומצות האמינו המשתרעות על קרום שהן גם הידרופוביות. למרות זאת, משאבות קרום ו תעלות יונים מכילים גם שאריות רבות ועמוסות קוטביות בקטעי הטרנסממברנה שאינם קוטביים.
באמצעות ניתוח הידרופוביות לחזות סלילים טרנסממברניים מאפשרת חיזוי בתור "טופולוגיה טרנסממברנית" של חלבון; כלומר חיזוי אילו חלקים ממנו בולטים לתא, אילו חלקים בולטים החוצה, וכמה פעמים שרשרת החלבון חוצה את הממברנה.
דוגמאות
- טטרספנינים יש 4 תחומים טרנסממברניים שמורים.
הפניות
- ^ היילי ג'יי שארפ; טים ג'יי סטיבנס; שון מונרו (9 ביולי 2010). "השוואה מקיפה של תחומים טרנס-ממברניים חושפת מאפיינים ספציפיים לאורגנלים". תָא. 142 (1): 158–169. דוי:10.1016 / j.cell.2010.05.037. PMC 2928124. PMID 20603021.