An exoribonuclease הוא exonuclease ריבונוקלאז, שהם אנזימים שמתפרקים RNA על ידי הסרת מסוף נוקלאוטידים משני ה סוף 5 ' או ה סוף 3 ' של מולקולת ה- RNA. אנזימים שמסירים נוקלאוטידים מקצה 5 'נקראים Exoribonucleases 5'-3 ', ואנזימים שמסירים נוקלאוטידים מקצה 3 'נקראים 3'-5 'exoribonucleases.
אקסוריבונוקלאזות יכולות להשתמש במים כדי לנתק את הקשר הנוקלאוטידי-נוקלאוטידי (הנקרא פעילות הידרוליטית) או פוספט אנאורגני (אשר נקרא פעילות פוספורוליטית). Exoribonucleases הידרוליטי מסווגים תחת מספר EC 3.1 ו- exoribonucleases פוספורוליטיות תחת מספר EC 2.7.7. מאחר שהאנזימים הפוספורוליטיים משתמשים בפוספט אנאורגני כדי לנתק קשרים שהם משחררים דו פוספטים נוקלאוטיד ואילו האנזימים ההידרוליטיים (המשתמשים במים) משתחררים מונוספוספטים נוקלאוטיד.
Exoribonucleases קיימים בכל ממלכות החיים, בַּקטֶרִיָה, ארכיא, ו אקריוטים. Exoribonucleases מעורבים בהשפלה של מינים רבים של RNA שונים, כולל שליח RNA, העברת RNA, RNA ריבוזומלי ו מירנה. Exoribonucleases יכולים להיות חלבונים בודדים (כגון RNase D. אוֹ RNase PH ) אך גם יכולים להיות קומפלקסים של חלבונים מרובים, כגון מורכב אקסוזום (בהן מיוצגות ארבע ממשפחות הגדולות של exoribonuclease).
משפחות מרכזיות
| מִשׁפָּחָה | חברים לדוגמא | הפצה | פעילות קטליטית |
|---|---|---|---|
| RNR | RNase R | רוב החיידקים, כולם אוקריוטים | 3'-5 'הידרוליטי |
| RNase II | |||
| Rrp44 | |||
| DEDD | RNase D. | חיידקים מסוימים, כולם אקריוטים | 3'-5 'הידרוליטי |
| RNase T. | |||
| PM / Scl-100 | |||
| אוליגוריבונוקלאז | |||
| RBN | RNase BN | חיידקים מסוימים | 3'-5 'הידרוליטי |
| PDX | PNPase | כל הממלכות | 3'-5 'פוספורוליטי |
| PM / Scl-75 | |||
| RNase PH | |||
| RRP4 | Rrp4 | כל האיקריוטים, ארכיים ביותר | 3'-5 'הידרוליטי |
| 5PX | Exoribonuclease אני | כל האיקריוטים | 5'-3 'הידרוליטי |
| Exoribonuclease II |
ראה גם
הפניות
- זואו Y; חבר פרלמנט דויטשר. (2001). "משפחות-על של אקסוריבונוקלאז: ניתוח מבני והפצה פילוגנטית". חומצות גרעין מיל. 29 (5): 1017–26. דוי:10.1093 / נאר / 29.5.1017. PMC 56904. PMID 11222749.
קישורים חיצוניים
- Exoribonucleases בספרייה הלאומית לרפואה בארה"ב כותרות נושא רפואי (רֶשֶׁת)