MRNA תת-גנומי - Subgenomic mRNA

לקבלת ה- RNA המדריך היחיד, ראה מדריך RNA.
למבנה הנתונים, ראה מודל סט מקונן.

תת-גנומי mRNA 'הם למעשה חלקים קטנים יותר מהמקור המתועתק גדיל תבנית.

3 'עד 5' DNA או RNA

בְּמַהֲלָך תַעֲתוּק, גדיל התבנית המקורי נקרא בדרך כלל מתוך 3' אל ה 5' סוף מההתחלה ועד הסוף. MRNAs תת-גנומי נוצרים כאשר תעתיק מתחיל בקצה 3 'של גדיל התבנית (או 5' של התבנית שתסונתז לאחרונה) ומתחיל להעתיק לקראת 5 'של קווצת התבנית לפני "קפיצה" לסוף של התבנית והעתקת הנוקליאוטידים האחרונים של קצה 5 'של התבנית, (גימור הזנב 3' לחוט החדש שנוצר).

כתוצאה מכך, לגדיל המתורגם יהיה קצה דומה 5 'בדרגות שונות עם התבנית המקורית (תלוי איזה חלק בתבנית התמלול קפץ מעל) וקצה 3' דומה לתבנית.[1]

5 'עד 3' (חוש חיובי) RNA נגיפי

RNA ויראלי בעל חוש-חיובי (5 'עד 3') אשר יכול להיות מתורגם ישירות לחלבונים הנגיפיים הרצויים, עובר תהליך דומה כמתואר ב -3 'עד 5'. ניתן לדלג על חלקים של ה- RNA הנגיפי במהלך התרגום.

תוֹצָאָה

התוצאה היא שהרבה שונים חלבונים ניתן ליצור מאותו גדיל mRNA, עם קצוות דומים של 5 '(בדרגות שונות) ואותם קצוות 3'. לחלופין, ניתן ליצור חלבונים שונים בעזרת RNA ויראלי בעל חוש חיובי.

החלק 5 'בגדיל החדש שנוצר תואם את זה של גדיל התבנית, וקטע זה בגדיל התבנית מכונה "הסט המקונן".[2]

3 '5' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATACGTTATTTCTGCGCGGAAAAAAAAA - תבנית מקורית גדיל 5 '3' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATAC --------------- AAAAA GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCAC -------------------------- AAAAAAAAA | = MRNA תת-גנומי. GCCGCCCCGTAT ---------------------------------------- AAAAAAAAA | GCCGCCCCGTAT = סט מקונן - מציין קפיצות.

דוגמאות

בדרך כלל שיטת תמלול מורכבת זו מוגבלת ל וירוסים, במיוחד אלה של חד-גדילי, חוש-חיובי RNA או וירוסים מסוג IV באמצעות מערכת סיווג בבולטימור, למשל וירוסים מהסדר Nidovirales.

הוא משמש בעיקר לדחיסה יותר גֵנֵטִי מידע לכמות קצרה יותר של חומר גנטי.[3]

סִפְרוּת

  1. ^ וו ב ', לבן KA (דצמבר 2007). "ביטול שכפול וירוס של RNA משעתוק באמצעות פולימראז: תובנות פונקציונליות ואבולוציוניות". כתב העת EMBO. 26 (24): 5120–30. דוי:10.1038 / sj.emboj.7601931. PMC  2140117. PMID  18034156.
  2. ^ Le, TM; וונג, ח"ה; טיי, FP; פאנג, S; קנג, CT; טאן, י.ג. ליו, DX (אוגוסט 2007). "ביטוי, שינוי לאחר טרנספורמציה ואפיון ביוכימי של חלבונים המקודדים על ידי mRNA8 תת-גנומי של התסמונת הקורונאובית החריפה החריפה". FEBS J. 274 (16): 4211–22. דוי:10.1111 / j.1742-4658.2007.05947.x. PMID  17645546.
  3. ^ שו וו, KA לבן (פברואר 2008). "תעתיק mRNA תת-גנומי בוירוס-וירוס: ויסות למטה של ​​תעתיק ואבולוציה של אלמנטים רגולטוריים של ה- RNA". וירולוגיה. 371 (2): 430–8. דוי:10.1016 / j.virol.2007.09.035. PMID  17988704.