נגיף אלפאקורונאון | |
---|---|
נגיף שלשול מגיפת חזירים מבנה הגנום והוויריון | |
סיווג וירוסים | |
(לא מדורג): | נגיף |
תְחוּם: | ריבוביריה |
מַלְכוּת: | אורטורנאווירה |
מַעֲרָכָה: | Pisuviricota |
מעמד: | Pisoniviricetes |
להזמין: | Nidovirales |
מִשׁפָּחָה: | Coronaviridae |
תת-משפחה: | Orthocoronavirinae |
סוּג: | נגיף אלפאקורונאון |
תת-זנים ומינים | |
וירוסים אלפאקורונוניים (Alpha-CoV) הם בני הראשון מבין ארבעת הסוגים (אלפא-, ביתא, גמא-, ו דֶלתָא- ) של נגיפי הקורונה. הם חוש חיובי, חד-גדילי נגיפי RNA שמדביקים גם בני אדם וגם יונקים. יש להם נגיעות כדוריות בצורת מועדון תחזיות שטח ו מעטפה ויראלית.
אלפאקורונווירוסים נמצאים בתת-המשפחה Orthocoronavirinae של המשפחה Coronaviridae. שניהם אלפא- ו נגיף בטקורון שושלות יורדות מה מאגר גנים נגיפי בת.[1][2][3] וירוסים אלפאקורונביים נקראו בעבר "פילוגראופ 1 קורונווירוסים ".
אֶטִימוֹלוֹגִיָה
השם alphacoronavirus נגזר מ יוון העתיקה ἄλφα (אלפא, "הראשון מִכְתָב של ה א 'ב' יווני ") ו- κορώνη (korṓnē," זר, זר "), כלומר כתר, המתאר את מראה הקרנות השטח הנראות במיקרוסקופ אלקטרונים הדומות ל קורונה סולארית.[4]
מִבְנֶה
הוויריון אפוף וכדורי בקוטר 120-160 ננומטר וקליפת ליבה של כ 65 ננומטר. גליקופרוטאינים וטרימרים יוצרים הקרנות פני שטח גדולות היוצרות מראה של קורונה סולארית. לסוג זה, כמו קורונאווירוסים אחרים, יש חלבון ספייק עם מכונת היתוך מסוג II (S2) ותחום מחייב קולטן (S1). זה מתאסף לתוך גוזם. שלא כמו בטא ו gammacoronaviruses, חלבון זה אינו מחולק לשני חצאים.[5]
גנום
הגנום הוא חוש חיובי, RNA חד-גדילי באורך של 27 עד 29 קילובייס וזנב 3'-polyA. שניים גדולים, חופפים ORFs בקצה 5'של הגנום מקודדים את החלבונים העיקריים שאינם מבניים המתבטאים כ- חלבון היתוך על ידי העברת מסגרות ריבוזומליות. אלה כוללים אזורים עם פרוטאז, הליקייס ומוטיבים של RNA פולימראז. ישנם שבעה גנים אחרים במורד הזרם המקודדים חלבונים מבניים. אלה באים לידי ביטוי ממערכת מקוננת 3'-coterminal של mRNAs תת-גנומיים.
רקומבינציה
שני סוגי נגיף אלפאקורונא 1, נגיף כתר קורונאי (FCoV) ו- וירוס כלילי (CCoV), ידועים כקיימים בשני סרטיפים. מטרות סרוטיפ II Aminopeptidase N בעוד שהקולטן לסרוטייפ I אינו ידוע. ההבדל נובע מחלבון ספייק שונה.[7] יש אב קדמון משותף ל- FCoV ו- CCoV. אב קדמון זה התפתח בהדרגה ל- FCoV I ו- CCoV I. חלבון S מנגיף לא ידוע שולב מחדש לאב הקדמון והוליד CCoV II. CCoV II שוב משולב מחדש עם FCoV כדי ליצור FCoV II. CCoV II התפתח בהדרגה ל- TGEV. מחיקת ספייק ב- TGEV יוצרת PRCV. כל הנגיפים הללו ממוינים בתת-סוגים וירוס טגאקו.[7]
מִיוּן
תת-זנים ומינים הבאים מוכרים:[8]
נגיף קורונה |
---|
חיסונים |
התפרצויות, מגיפות, ומגפות
|
- וירוס המינאקו
- וירוס מינונאקו
- וירוס מיוטאק
- וירוס Nyctacovirus
- וירוס Pedacov
- נגיף רינקוב
- וירוס Setracovirus
- וירוס סורקוב
- וירוס Sunacovirus
- וירוס טגאקו
ראה גם
הפניות
- ^ וו, פ. ג .; וואנג, מ '; לאו, ס. ק .; שו, ח .; Poon, R. W .; גואו, ר '; וונג, ב 'ה'; גאו, ק '; צוי, ה 'ו'; הואנג, י '; Li, K. S .; לאם, סי 'ס; צ'אן, ק 'ה'; ג'נג, ב 'ג'יי; Yuen, K. Y. (2007). "ניתוח השוואתי של שנים עשר גנום של שלושה קורונווירוסים מקבוצת 2c וקבוצת 2d חדשים מגלה תכונות ייחודיות של קבוצות ותת-קבוצות". כתב העת לווירולוגיה. 81 (4): 1574–85. דוי:10.1128 / JVI.02182-06. PMC 1797546. PMID 17121802.
- ^ לאו, ס. ק .; וו, פ. ג .; ייפ, סי ג; מניפה, ר 'י'; הואנג, י '; וואנג, מ '; גואו, ר '; לאם, סי 'ס; צאנג, א. ק .; Lai, K. K .; צ'אן, ק 'ה'; צ'ה, X. Y .; ג'נג, ב 'ג'יי; Yuen, K. Y. (2012). "בידוד ואפיון של תת-קבוצה חדשה של נגיף בטאקורונאוס וירוס כתר, וירוס כתר אלמוגים HKU14, מארנבים ביתיים". כתב העת לווירולוגיה. 86 (10): 5481–96. דוי:10.1128 / JVI.06927-11. PMC 3347282. PMID 22398294.
- ^ לאו, ס. ק .; Poon, R. W .; וונג, ב 'ה'; וואנג, מ '; הואנג, י '; שו, ח .; גואו, ר .; לי, ק. ס .; גאו, ק '; צ'אן, ק 'ה'; ג'נג, ב 'ג'יי; וו, פ. ג .; Yuen, K. Y. (2010). "דו קיום של גנוטיפים שונים באותו עטלף ואפיון סרולוגי של נגיף העטרה רוזטוס העטלף HKU9 השייך לתת-קבוצה חדשה של נגיף בטקורון". כתב העת לווירולוגיה. 84 (21): 11385–94. דוי:10.1128 / JVI.01121-10. PMC 2953156. PMID 20702646.
- ^ דקארו, ניקולה (2011). "וירוס אלפאקורונא". מדד הנגיפים של ספרינגר. עמ '371-383. דוי:10.1007/978-0-387-95919-1_56. ISBN 978-0-387-95918-4.
- ^ וראפ, דניאל; מקללן, ג'ייסון ס .; גלאגר, טום (13 בנובמבר 2019). "מבנה מיקרוסקופ הקריו-אלקטרונים 3.1-אנגסטרום של נגיף השלשול מגיפי החזיר בחלבון בתצורת הזיהוי". כתב העת לווירולוגיה. 93 (23): e00923-19. דוי:10.1128 / JVI.00923-19. PMC 6854500. PMID 31534041.
- ^ לה פודר, סופי (2011-07-31). "קורונווירוסים בקו ובכלב: תכונות גנטיות ופתוביולוגיות שכיחות". התקדמות בווירולוגיה. הוחזר 2020-06-29.
- ^ א ב חיימס, חוויאר א .; דוחן, ז'אן ק.; סטאוט, אליסון א .; אנדרה, ניקול מ.; ויטאקר, גארי ר '(10 בינואר 2020). "סיפור של שני נגיפים: גליקופרוטאינים ספייק מובחנים של קורונבירוסים חתולים". וירוסים. 12 (1): 83. דוי:10.3390 / v12010083. PMC 7019228. PMID 31936749.
- ^ "טקסונומיית וירוסים: שחרור 2019". talk.ictvonline.org. הוועדה הבינלאומית לטקסונומיה של נגיפים. הוחזר 20 ביוני 2020.