נגיף בטקורון - Betacoronavirus

נגיף בטקורון
109239.fig.001abcd.png
נגיף כלילי מורין (MHV) virion מיקרוגרף אלקטרונים, מבנה סכמטי וגנום
סיווג וירוסים ה
(לא מדורג):נגיף
תְחוּם:ריבוביריה
מַלְכוּת:אורטורנאווירה
מַעֲרָכָה:Pisuviricota
מעמד:Pisoniviricetes
להזמין:Nidovirales
מִשׁפָּחָה:Coronaviridae
תת-משפחה:Orthocoronavirinae
סוּג:נגיף בטקורון
סוג מינים
נגיף כלילי מורין (MHV)
תת-זנים ומינים

ראה טקסט

נגיף בטקורון (β-CoVs או Beta-CoVs) הוא אחד מארבעה סוגים (אלפא -, ביתא, גמא-, ו דֶלתָא- ) של נגיפי הקורונה. וירוסים של חברים הם עָטוּף, נגיפי RNA חיוביים שמדביקים יונקים (מתוכם בני אנוש חלק). ה מאגר טבעי שכן בטאקורונווירוסים הם עטלפים ומכרסמים. מכרסמים הם המאגר של תת-הסוג וירוס אמבקו, בזמן עטלפים הם המאגר עבור תת-דוריות האחרות.[1]

סוגים של נגיף העטרה מורכבים כל אחד משושלות ויראליות שונות עם הסוג של נגיף הבטאקורונא המכיל ארבע שושלות כאלה: A, B, C, D. בספרות ישנה יותר, סוג זה ידוע גם כ"קורונווירוסים מקבוצה 2 ". הסוג נמצא בתת-המשפחה Orthocoronavirinae במשפחה Coronaviridae, לפי הסדר Nidovirales.

הווירוסים הבטקורונוניים בעלי החשיבות הקלינית הגדולה ביותר הנוגעים לבני אדם הם OC43 ו HKU1 (שעלול לגרום ל הצטננות ) של שושלת A, SARS-CoV ו SARS-CoV-2 (הגורם למחלה COVID-19 ) של שושלת B,[2] ו MERS-CoV של שושלת ג. MERS-CoV הוא נגיף הבטאקורון הראשון השייך לשושלת C שידוע כי הוא מדביק בני אדם.[3][4]

אֶטִימוֹלוֹגִיָה

השם "נגיף בטקורון" נגזר מ יוון העתיקה βῆτα (bē̂ta, "השני מִכְתָב של ה א 'ב' יווני ") ו- κορώνη (korṓnē," זר, זר "), כלומר כתר, המתאר את מראה הקרנות פני השטח הנראות במיקרוסקופ אלקטרונים הדומות ל קורונה סולארית. זֶה מוֹרפוֹלוֹגִיָה נוצר על ידי ספייק ויראלי (S) peplomers, שהם חלבונים המאכלסים את פני הנגיף וקובעים מארח טרופיזם. הסדר Nidovirales נקרא על שם הלטינית נידו, שפירושו 'קן'. הכוונה היא לייצור של סדר זה של סט מקונן של 3'-coterminal mRNAs תת-גנומיים במהלך ההדבקה.[5]

מִבְנֶה

איור של SARSr-CoV virion

כמה מבנים של חלבוני הספייק נפתרו. תחום הקישור לקולטן בחלבון הדוקרן של אלפא ובטקורון, מקוטלג כ- אינטרפרו: IPR018548.[6] חלבון הספייק, א מכונת היתוך מסוג 1, מתכנס לטימר (PDB: 3jcl, 6acg); מבנה הליבה שלו דומה לזה של וירוס פרמיקסוקס חלבוני F (היתוך).[7] השימוש בקולטן אינו שמור במיוחד; למשל, בין וירוס סרבק, רק תת-שושלת המכילה SARS חולקים את ACE2 קוֹלֵט.

הנגיפים של תת-זנים וירוס אמבקו נבדלים מכל האחרים בסוג בכך שהם מכילים חלבון קצר יותר (8 ננומטר) כמו דוקרן hemagglutinin esterase (HE) (P15776). הוא האמין כי נרכש מ נגיף שפעת C.[5][8]

גנום

הגנום של וירוסים אלפאקורונוניים וירוסים בטקורוניים

Coronaviruses יש גדול גנום גודל שנע בין 26 ל -32 קילו-בסיסים. המבנה הכללי של הגנום β-CoV דומה לזה של CoVs אחרים, עם פולי-פרוטאין משוכפל של ORF1ab (נציג, pp1ab) לפני אלמנטים אחרים. פולי-פרוטאין זה נקטע ב -16 חלבונים לא מבניים (ראה הערת UniProt של SARS נציג, P0C6X7).

החל ממאי 2013, GenBank פרסמה 46 גנומים מלאים של α- (קבוצה 1), β- (קבוצה 2), γ- (קבוצה 3) ו- δ- (קבוצה 4).[9]

רקומבינציה

רקומבינציה גנטית יכול להתרחש כאשר שניים ויראליים או יותר גנום נמצאים באותו תא מארח. ה דרומדרי גמל ביתא-קואו HKU23 מציג מגוון גנטי באוכלוסיית הגמלים האפריקאית.[10] לתרום למגוון זה מספר אירועי רקומבינציה שהתרחשו בעבר בין בטא-קורונאווירוסים הקשורים זה לזה של תת-סוגים. וירוס אמבקו.[10] גם נגיף הבטקורון, אנושי SARS-CoV, נראה שיש לו היסטוריה מורכבת של רקומבינציה בין אבות נגיפי הקורונה שהתארחו בכמה קבוצות בעלי חיים שונות.[11][12]

פתוגנזה

וירוסים של אלפא ובטקורון מדביקים בעיקר עטלפים, אך הם מדביקים גם מינים אחרים כמו בני אנוש, גמלים, ו מכרסמים.[13][14][15][16] וירוסים בטקורונאיים שגרמו למגיפות בבני אדם גורמים בדרך כלל לתופעות חום ונשימה. הם כוללים:

מִיוּן

עץ פילוגנטי משושלות הסוג נגיף בטקורון עם פירוט עבור SARS-CoV ו MERS-CoV

בתוך הסוג נגיף בטקורון (קבוצה 2 CoV), ארבע תת-דוריות או שושלות (A, B, C ו- D) הוכרו באופן מסורתי.[5] ארבע השושלות נקראו גם באותיות יווניות או באופן מספרי.[9] תת-סוג חמישי, וירוס היבקו, נוסף לאחרונה.[17] תת-סוגים של חברים ומינים כוללים:[18]

וירוס אמבקו (שושלת A)

מאמר מרכזי: וירוס אמבקו

נגיף בטקורון 1

וירוס קורונה של סין Rattus HKU24
נגיף העטרה האנושי HKU1
נגיף כלילי מורין

Myodes coronavirus 2JL14

וירוס סרבק (שושלת B)

מאמר מרכזי: וירוס סרבק

וירוס קורונה חריף הקשור לתסמונת הנשימה (SARSr-CoV או SARS-CoV)

נגיף קורונה
נגיף H1N1

וירוס מרבק (שושלת ג ')

מאמר מרכזי: וירוס מרבק

נגיף כתר הקיפוד 1
וירוס כורונה הקשור לתסמונת הנשימה במזרח התיכון (MERS-CoV)
וירוס העטרה של פיפיסטרלוס עטלף HKU5
וירוס העטרה קורונאיס Tylonycteris HKU4

נגיף נובקוב (שושלת D)

מאמר מרכזי: נגיף נובקוב

נגיף העטרה Eidolon C704
וירוס העטרה של כורסת החתול GCCDC1
וירוס העטרה Rousettus עטלף HKU9

וירוס היבקו

מאמר מרכזי: וירוס היבקו

נגיף בת Hp-betacoronav Zhejiang 2013

ראה גם

הפניות

  1. ^ וארטצקי, אדריאן; Rzymski, פיוטר (יוני 2020). "על Coronaviruses והקשרים שלהם עם הסביבה הימית ושפכים". מים. 12 (6): 1598. דוי:10.3390 / w12061598.
  2. ^ "פילוגניה של בטאקורונווירוסים דמויי SARS". הזן הבא. הוחזר 18 בינואר 2020.
  3. ^ ProMED. MERS-CoV – מזרח הים התיכון (06) (http://www.promedmail.org/ )
  4. ^ ממיש, ז''א; Zumla, A. I .; אל-האקם, ר 'פ'; אל-רבאה, א. א .; סטפנס, ג 'מ' (2013). "אשכול משפחתי של זיהומים בנגיף קורונאווה בתסמונת הנשימה במזרח התיכון". כתב העת לרפואה של ניו אינגלנד. 368 (26): 2487–94. דוי:10.1056 / NEJMoa1303729. PMID  23718156.
  5. ^ א ב ג וו, פטריק סי. י. הואנג, יי; לאו, סוזנה ק. פ .; יואן, קווק-יונג (24/08/2010). "ניתוח גנומיקה וירוס קורונה וביואינפורמטיקה". וירוסים. 2 (8): 1804–20. דוי:10.3390 / v2081803. PMC  3185738. PMID  21994708.
  6. ^ הואנג, ג; צ'י, ג'י; לו, ז; וואנג, ש; יואן, י; וו, י; ג'אנג, י; יאן, ג'יי; גאו, GF (1 בנובמבר 2016). "תחום מחייב קולטנים משוער של נגיף קורונה נגיף עטלף HKU9 חלבון ספייק: התפתחות מוטיבים לקשירת קולטני נגיף בטאקורונאווה". בִּיוֹכִימִיָה. 55 (43): 5977–88. דוי:10.1021 / acs.biochem.6b00790. PMID  27696819.
  7. ^ וולס, אלכסנדרה ג .; טורטוריצ'י, מ 'אלחנדרה; בוש, ברנד-ג'אן; פרנץ, ברנדון; רוטייה, פיטר ג'יי מ '; דימאיו, פרנק; ריי, פליקס א .; ויסלר, דייויד (8 בפברואר 2016). "מבנה מיקרוסקופי קריו-אלקטרונים של גוזם גלוקופרוטאין ספייק וירוס". טֶבַע. 531 (7592): 114–117. ביבקוד:2016Natur.531..114W. דוי:10.1038 / nature16988. PMC  5018210. PMID  26855426.
  8. ^ Bakkers, Mark J. G .; לאנג, ייפיי; פייטסמה, לוריס י. Hulswit, Ruben J. G .; פוט, סטפני א.ה דה; Vliet, Arno L. W. van; מרגין, אירינה; גרוט-מיינס, ג'ולנדה ד.פ דה; קופפלד, פרנק ג'יי מ 'ואן; Langereis, Martijn A.; Huizinga, Eric G. (2017-03-08). "הסתגלות וירוס בטקורונאית לבני אדם המעורבים באובדן פרוגרסיבי של המגגלוטינין-אסטרזיס פעילות לקטין". מארח תא ומיקרוב. 21 (3): 356–366. דוי:10.1016 / j.chom.2017.02.008. ISSN  1931-3128. PMID  28279346.
  9. ^ א ב קוטן, מתיו; לאם, טומי ט .; ווטסון, סיימון י. פאלסר, אן ל '; פטרובה, וליסלבה; גרנט, פול; פייבוס, אוליבר ג'י; רמבו, אנדרו; גואן, יי; פיליי, דינן; קלם, פול; נסטולי, אלני (2013-05-19). "רצף עמוק של הגנום המלא וניתוח פילוגנטי של נגיף בטקורונא אנושי חדש". מחלות זיהומיות מתפתחות. 19 (5): 736-42 ב. דוי:10.3201 / eid1905.130057. PMC  3647518. PMID  23693015.
  10. ^ א ב המגוון של נגיף Coronaval HKD23 של גמל הדרומדרי בגמלים אפריקניים חשף אירועי רקומבינציה מרובים בקרב וירוסי בטקורונאובי קשורים מקרוב של נגיף ה- Embecovirus. אז RTY, et al. ג'י וירול. 2019. PMID  31534035
  11. ^ Stanhope MJ, Brown JR, Amrine-Madsen H. עדויות מהניתוח האבולוציוני של רצפי נוקליאוטידים להיסטוריה רקומביננטית של SARS-CoV. להדביק Evol Evol. מרץ 2004; 4 (1): 15-9. PMID  15019585
  12. ^ Zhang XW, Yap YL, Danchin A. בדיקת ההשערה על מקור רקומביננטי של נגיף העטרה הקשור ל- SARS. קשת וירול. ינואר 2005; 150 (1): 1-20. Epub 2004 11 באוקטובר. PMID  15480857
  13. ^ וו, פ. ג .; וואנג, מ '; לאו, ס. ק .; שו, ח .; Poon, R. W .; גואו, ר '; וונג, ב 'ה'; גאו, ק '; צוי, ה 'ו'; הואנג, י '; לי, ק. ס .; לאם, סי 'ס; צ'אן, ק 'ה'; ג'נג, ב 'ג'יי; Yuen, K. Y. (2007). "ניתוח השוואתי של שנים עשר גנום של שלושה קורונווירוסים מקבוצת 2c וקבוצת 2d חדשים מגלה תכונות ייחודיות של קבוצות ותתי קבוצות". כתב העת לווירולוגיה. 81 (4): 1574–85. דוי:10.1128 / JVI.02182-06. PMC  1797546. PMID  17121802.
  14. ^ לאו, ס. ק .; וו, פ. ג .; ייפ, סי ג; מניפה, ר 'י'; הואנג, י '; וואנג, מ '; גואו, ר '; לאם, סי 'ס; צאנג, א. ק .; Lai, K. K .; צ'אן, ק 'ה'; צ'ה, X. Y .; ג'נג, ב 'ג'יי; Yuen, K. Y. (2012). "בידוד ואפיון של תת-קבוצה חדשה של נגיף בטקורונא, נגיף כורונה, וירוס קורונא ארנב HKU14, מארנבים ביתיים". כתב העת לווירולוגיה. 86 (10): 5481–96. דוי:10.1128 / JVI.06927-11. PMC  3347282. PMID  22398294.
  15. ^ לאו, ס. ק .; Poon, R. W .; וונג, ב 'ה'; וואנג, מ '; הואנג, י '; שו, ח .; גואו, ר '; לי, ק. ס .; גאו, ק '; צ'אן, ק 'ה'; ג'נג, ב 'ג'יי; וו, פ. ג .; Yuen, K. Y. (2010). "דו קיום של גנוטיפים שונים באותו עטלף ואפיון סרולוגי של נגיף העטרה רוזטוס העטלף HKU9 השייך לתת-קבוצה חדשה של נגיף בטקורון". כתב העת לווירולוגיה. 84 (21): 11385–94. דוי:10.1128 / JVI.01121-10. PMC  2953156. PMID  20702646.
  16. ^ ג'אנג, ווי; ג'נג, שיאו-שואנג; אגוונדה, ברנרד; אוממה, שילה; ג'או, קאי; ליכוטי, ז'קלין; וואנג, נינג; חן, ג'ינג; לי, ביי; יאנג, שינג-לו; מאני, שיילנדרה; נגייווה, קיסה-ג'ומה; ג'ו, יאן; הו, בן; אוניוק, שמשון אומונדי; יאן, בינג; אנדרסון, דניאל א .; וואנג, לין-פא; ג'ואו, פנג; שי, ג'נג-לי (24 באוקטובר 2019). "עדויות סרולוגיות להדבקה משותפת ב- CoV ב- MERS-CoV ו- HKU8 בגמלים בקניה". חיידקים וזיהומים מתפתחים. 8 (1): 1528–1534. דוי:10.1080/22221751.2019.1679610. PMC  6818114. PMID  31645223.
  17. ^ וונג, אנטוניו סי.פי; לי, שין; לאו, סוזנה ק.פ; וו, פטריק סי. י. (2019). "אפידמיולוגיה עולמית של בת Coronaviruses". וירוסים. 11 (2): 174. דוי:10.3390 / v11020174. PMC  6409556. PMID  30791586.
  18. ^ "טקסונומיית וירוסים: שחרור 2019". talk.ictvonline.org. הוועדה הבינלאומית לטקסונומיה של נגיפים. הוחזר 20 ביוני 2020.

קישורים חיצוניים